פחמן דו חמצני בקפה נוצר כחלק מריאקציות כימיות כגון פירוק חומצה כלורגנית / (Chlorogenic Acid (CGA וריאקצית מאיאר / Maillard Reaction. חלקו הגדול של הפחמן הדו חמצני מתפנה ונפלט במהלך הקליה עצמו אך גם לאחריה ישנו תהליך בשם דיגאסינג אותו עוברים פולי הקפה ובהם משתחרר פחמן דו חמצני באופן איטי מהפול אל הסביבה. פחמן דו חמצני גם נוצר במהלך עיבודי קפה שונים בעקבות ההתססה של הסוכרים במעטפת הפול. בחליטה עצמה, תופעות הקרמה והבלום גם הן נשענות על פחמן דו חמצני.
